RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PNMA5Q96PV4 448 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 TRIOO75962 3097 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 CARNS1A5YM72 827 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 HIDE1A8MVS5 230 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 DDHD2O94830 711 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 NPTXRO95502 500 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 POMCP01189 267 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 SLC11A1P49279 550 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 NDUFV1P49821 464 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 TMC7Q7Z402 723 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 DEPTORQ8TB45 409 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 IGSF21Q96ID5 467 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 IFT74Q96LB3 600 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 CLEC1BQ9P126 229 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 ARL5CA6NH57 179 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 EDN1P05305 212 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 SYT1P21579 422 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 MAPK6Q16659 721 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP6Q16828 381 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 DAW1Q8N136 415 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 ZFP42Q96MM3 310 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 GAD1Q99259 594 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 APOL6Q9BWW8 343 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 PRKCBP05771 671 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 MLH1P40692 756 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 VN1R2Q8NFZ6 395 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 USP20Q9Y2K6 914 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXB3-202ENST00000460160 ACKR2O00590 384 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 HIP1RO75146 1068 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 BMP15O95972 392 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 AK8Q96MA6 479 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 PLIN2Q99541 437 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 CD207Q9UJ71 328 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 LIG1P18858 919 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 AKAP5P24588 427 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 EFNA5P52803 228 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 MAPK7Q13164 816 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 HACE1Q8IYU2 909 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 VPS52Q8N1B4 723 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 CD320Q9NPF0 282 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 MIOSQ9NXC5 875 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 FAM50BQ9Y247 325 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 FSD2A1L4K1 749 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 N4BP3O15049 544 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 MBTPS2O43462 519 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SCNN1GP51170 649 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 ZBP1Q9H171 429 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 NPTX2P47972 431 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 PEX3P56589 373 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 GRIN1Q05586 938 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 DSC1Q08554 894 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 RESTQ13127 1097 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 KCNC3Q14003 757 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 CABP7Q86V35 215 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 DRC1Q96MC2 740 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 TRIP11Q15643 1979 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 ALDH2P05091 517 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 GUCY2CP25092 1073 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SLC12A3P55017 1021 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 COASYQ13057 564 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 SNX21Q969T3 373 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-202ENST00000460160 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms