RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 GAD1Q99259 594 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF39Q9H2S5 420 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 KLK14Q9P0G3 267 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 IPPQ9Y573 584 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ARL5CA6NH57 179 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 B4GALT3O60512 393 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPAN1O60635 241 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 DGAT1O75907 488 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 NPTXRO95502 500 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 URODP06132 367 aa9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 AXLP30530 894 aa9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 SCNN1GP51170 649 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PTENP60484 403 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPN14Q15678 1187 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF174Q15697 407 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 IER5LQ5T953 404 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 RABGGTAQ92696 567 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CSRNP2Q9H175 543 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNH6Q9H252 994 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIP11Q15643 1979 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 POTEMA6NI47 508 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 STK25O00506 426 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TADA2AO75478 443 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 CAPSQ13938 189 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PALB2Q86YC2 1186 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 ERMNQ8TAM6 284 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFRSF25Q93038 417 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf76Q96K31 380 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 NACC1Q96RE7 527 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 PIDD1Q9HB75 910 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 POLD4Q9HCU8 107 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 MIOSQ9NXC5 875 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 STK39Q9UEW8 545 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 SEC24BO95487 1268 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 SOD2P04179 222 aa9.49□□□□□ -0.89
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SH3BP1-204ENST00000459646 ARL2P36404 184 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 GLUD2P49448 558 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 RARRES1P49788 294 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CLCN4P51793 760 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPN5P54829 565 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP57Q86XR8 500 aa9.49□□□□□ -0.89
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