RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 MYCT1Q8N699 235 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PDILTQ8N807 584 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 HELQQ8TDG4 1101 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX12PQ92771 950 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 LPPQ93052 612 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TNMDQ9H2S6 317 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CWH43Q9H720 699 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CARNS1A5YM72 827 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 INPPL1O15357 1258 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAK2O60296 914 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TBCAO75347 108 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 EDN1P05305 212 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 LAG3P18627 525 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 LIG1P18858 919 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 IGFBP4P22692 258 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CMA1P23946 247 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 GPM6BQ13491 265 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 RSAD1Q9HA92 442 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO9BQ13459 2157 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 NPTXRO95502 500 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 AMPD3Q01432 767 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 STRN3Q13033 797 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPROQ16827 1216 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ZPBP2Q6X784 338 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF39Q9H2S5 420 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 GAP43P17677 238 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 LONRF3Q496Y0 759 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 DYMQ7RTS9 669 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 URGCPQ8TCY9 931 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX58Q96C10 678 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 FIZ1Q96SL8 496 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 USP20Q9Y2K6 914 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 HES2Q9Y543 173 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-204ENST00000442563 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQ27 194 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQ64 194 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQD8 194 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 PROZP22891 400 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2BQ00403 316 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE3AQ05086 875 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 TOM1L1O75674 476 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCB3Q01970 1234 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF558Q96NG5 402 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 GAD1Q99259 594 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.5■□□□□ 0.55
RABGEF1-204ENST00000442563 HCSTQ9UBK5 93 aa18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms