RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 KMOO15229 486 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TOMM70O94826 608 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PAHP00439 452 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PDGFRBP09619 1106 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FUT4P22083 530 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAR1BP31321 381 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 USP11P51784 963 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF7Q02833 373 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 AK5Q9Y6K8 562 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 PCNAP12004 261 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ATP9BO43861 1147 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 USP12O75317 370 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TJP3O95049 919 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CYP1A2P05177 515 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RCVRNP35243 200 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PGM1P36871 562 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 GPD2P43304 727 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC34A1Q06495 639 aa5.92□□□□□ -1.46
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