RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ARL5CA6NH57 179 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 NRP1O14786 923 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 MED24O75448 989 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 POMCP01189 267 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ALDH2P05091 517 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 OR52Z1P0C646 297 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CA8P35219 290 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 RNF39Q9H2S5 420 aa23.12■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 CDH22Q9UJ99 828 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 LILRB3O75022 631 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 EFEMP2O95967 443 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 TRAPPC10P48553 1259 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 NACC1Q96RE7 527 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 NR2E1Q9Y466 385 aa23.11■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 A0A1B0GUA9 196 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM221A6NGB7 291 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 M0R296 226 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 B4GALT5O43286 388 aa23.1■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 EPCAMP16422 314 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 MUTP22033 750 aa23.1■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN4-204ENST00000426921 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.1■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 MIOSQ9NXC5 875 aa23.08■■□□□ 1.29
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UBXN4-204ENST00000426921 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.07■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 FBXL18Q96ME1 805 aa23.07■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.07■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 PIEZO1Q92508 2521 aa23.07■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.06■■□□□ 1.28
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP11B2P19099 503 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.287e-7■■□□□ 11.9
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UBXN4-204ENST00000426921 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN4-204ENST00000426921 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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