RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D13Q9NVG8 400 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 KCND2Q9NZV8 630 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa27.56■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 FGF18O76093 207 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT18P05783 430 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 DDIT3P35638 169 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 URGCPQ8TCY9 931 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF558Q96NG5 402 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PDZD7Q9H5P4 517 aa27.55■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 N4BP3O15049 544 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 YEATS4O95619 227 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 POMCP01189 267 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PLS3P13797 630 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP5P24588 427 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMK1Q14012 370 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 POF1BQ8WVV4 589 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 REEP2Q9BRK0 252 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 C17orf75Q9HAS0 396 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.54■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP6R2O75170 966 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TCEAL5Q5H9L2 206 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 HACE1Q8IYU2 909 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 GAD1Q99259 594 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZHX3Q9H4I2 956 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PARP2Q9UGN5 583 aa27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 BRD1O95696 1058 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 BCAR1P56945 870 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 GIT2Q14161 759 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS1R3Q7RTX0 852 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF280BQ86YH2 543 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 SPG21Q9NZD8 308 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 KLK14Q9P0G3 267 aa27.52■■■□□ 2
HTATSF1-202ENST00000425695 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A087X0B3 334 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM13AO94988 1023 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 IRS1P35568 1242 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 MLH1P40692 756 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 SMTNP53814 917 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 MYCT1Q8N699 235 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PDILTQ8N807 584 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFP42Q96MM3 310 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ADPGKQ9BRR6 497 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 MIOSQ9NXC5 875 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 THEGQ9P2T0 379 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJB4Q9UDY4 337 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 STK17AQ9UEE5 414 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27.51■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ARL5CA6NH57 179 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 B4GALT3O60512 393 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 CUTAO60888 179 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 DDHD2O94830 711 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH1Q8WYR4 309 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 SNTG2Q9NY99 539 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 KANSL3Q9P2N6 904 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP45Q9UL16 551 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 GIT1Q9Y2X7 761 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.5■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 STAT6P42226 847 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 SCNN1GP51170 649 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 TFF2Q03403 129 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ATL3Q6DD88 541 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 SV2BQ7L1I2 683 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 DYMQ7RTS9 669 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 GALTP07902 379 aa27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PPM1AP35813 382 aa27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ME1P48163 572 aa27.48■■□□□ 1.99
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVFC1P60507 584 aa27.48■■□□□ 1.99
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