RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 N4BP3O15049 544 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP6R2O75170 966 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CSPG5O95196 566 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 EDN1P05305 212 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TXLNAP40222 546 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 BCAR1P56945 870 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCB3Q01970 1234 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE3AQ05086 875 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 HACE1Q8IYU2 909 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 APOL6Q9BWW8 343 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PANK2Q9BZ23 570 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SPG21Q9NZD8 308 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A4O15374 487 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 YEATS4O95619 227 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP5P24588 427 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SMTNP53814 917 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT17Q04695 432 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ATL3Q6DD88 541 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 HLA-CQ95604 372 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GAD1Q99259 594 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 THEGQ9P2T0 379 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 COG5Q9UP83 839 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL5CA6NH57 179 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 POMCP01189 267 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 IRS1P35568 1242 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PPM1AP35813 382 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GIT2Q14161 759 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 BECN1Q14457 450 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 REEP2Q9BRK0 252 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GBP3Q9H0R5 595 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MIOSQ9NXC5 875 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP2Q9UGN5 583 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 DDHD2O94830 711 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH2P05091 517 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 GALTP07902 379 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVFC1P60507 584 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 STK17AQ9UEE5 414 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP45Q9UL16 551 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 LZTS1Q9Y250 596 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 INPPL1O15357 1258 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 BRD1O95696 1058 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MLH1P40692 756 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SV2BQ7L1I2 683 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCT1Q8N699 235 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP42Q96MM3 310 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TLR9Q9NR96 1032 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 SNTG2Q9NY99 539 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 KLK14Q9P0G3 267 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CARNS1A5YM72 827 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CUTAO60888 179 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM13AO94988 1023 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TFF2Q03403 129 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB2Q96Q27 587 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087X0B3 334 aa23.19■■□□□ 1.3
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