RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 HIC1Q14526 733 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GNASQ5JWF2 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PGK1P00558 417 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 VTNP04004 478 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 HOXC8P31273 242 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 FMO5P49326 533 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP4BP1P59074 171 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 RAET1EQ8TD07 263 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MAP7D2Q96T17 732 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC7Q99615 494 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SPC25Q9HBM1 224 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 A0A0B4J269 797 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ACKR2O00590 384 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 EXTL3O43909 919 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NOL4O94818 638 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PHKA2P46019 1235 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KCNJ6P48051 423 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 DLG4P78352 724 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZBED6P86452 979 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NEK11Q8NG66 645 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 A0A087WZ62 844 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GPC3P51654 580 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ENPEPQ07075 957 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CBWD6Q4V339 395 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GBP6Q6ZN66 633 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP6O43182 974 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TOM1L1O75674 476 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 IQCF3P0C7M6 154 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PON1P27169 355 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CYP24A1Q07973 514 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 FAM187BQ17R55 369 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ABLIM1O14639 778 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SLC9A1P19634 815 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PROZP22891 400 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PPP3CAQ08209 521 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF6Q15052 776 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF410Q86VK4 478 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TMC2Q8TDI7 906 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 BAP1Q92560 729 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GANQ9H2C0 597 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 BRCA2P51587 3418 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF233A6NK53 670 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GCNT4Q9P109 453 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CEP72Q9P209 647 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PMM2O15305 246 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CLDN3O15551 220 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZEB2O60315 1214 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CYP2C9P11712 490 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PRMT2P55345 433 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 APBA1Q02410 837 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 AMHR2Q16671 573 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 P4HA2O15460 535 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TREHO43280 583 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms