RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa2.67□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 BHLHA9Q7RTU4 235 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 MIEF2Q96C03 454 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCF25Q9BQ70 676 aa2.67□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR39O43194 453 aa2.66□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 CDK4P11802 303 aa2.66□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 NECAB2Q7Z6G3 386 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
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RNU6-407P-201ENST00000365280 PACSIN3Q9UKS6 424 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM75PA6NK02 468 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZAR1LA6NP61 321 aa2.64□□□□□ -1.99
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RNU6-407P-201ENST00000365280 CANXP27824 592 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC5A3P53794 718 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRT85P78386 507 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 DUSP2Q05923 314 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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