RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYL3P08590 195 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF28P17035 718 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLD1P28340 1107 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 ECHS1P30084 290 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 ETV4P43268 484 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 LIMS1P48059 325 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 STAT5BP51692 787 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 HK3P52790 923 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACNB3P54284 484 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 AK2P54819 239 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC42EP1Q00587 391 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOGQ13253 232 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE3CQ15386 1083 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 LONRF1Q17RB8 773 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q6ZVL8 140 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLEC14AQ86T13 490 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAAM2Q86T65 1068 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DRC7Q8IY82 874 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNX33Q8WV41 574 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAMD11Q96NU1 681 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DIRC2Q96SL1 478 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SGPP1Q9BX95 441 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 RSAD1Q9HA92 442 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 GCM1Q9NP62 436 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLHQ9Y253 713 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 VWA7Q9Y334 891 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRAMEF4O60810 478 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHF2O75151 1096 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLHL18O94889 574 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PEX2P28328 305 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 SREBF1P36956 1147 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNQ1P51787 676 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAB1AP62820 205 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPSM2P81274 684 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF827Q17R98 1081 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOA5Q6Q788 366 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRLQ86TD4 932 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF480Q8WV37 535 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAB24Q969Q5 203 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUDT11Q96G61 164 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYD88Q99836 296 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCO1Q9HAY6 547 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNK12Q9HB15 430 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 TDP1Q9NUW8 608 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-655P-201ENST00000362858 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms