RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 OFD1O75665 1012 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 GLP2RO95838 553 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ITGA4P13612 1032 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CYP11B2P19099 503 aa8.48□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM15Q13444 863 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PDIA5Q14554 519 aa8.48□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 KRT79Q5XKE5 535 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.48□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.48□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 IPPQ9Y573 584 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PLXNA3P51805 1871 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 CITO14578 2027 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.47□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 HIDE1A8MVS5 230 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-201ENST00000361543 PER2O15055 1255 aa8.47□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.47□□□□□ -1.05
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SGMS1-201ENST00000361543 DDHD2O94830 711 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 EYA4O95677 639 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 POMCP01189 267 aa8.46□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 GALTP07902 379 aa8.46□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK6Q16659 721 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FAM187BQ17R55 369 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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