RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 WDR90Q96KV7 1748 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 DVL2O14641 736 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 NPHS1O60500 1241 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 POU2F2P09086 479 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 AGXTP21549 392 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LAPTM5Q13571 262 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PDCD1Q15116 288 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LONRF1Q17RB8 773 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 WDR78Q5VTH9 848 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FYB2Q5VWT5 728 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MBLAC2Q68D91 279 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LILRA6Q6PI73 481 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 NAT16Q8N8M0 369 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MYLIPQ8WY64 445 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SCLT1Q96NL6 688 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 CDIP1Q9H305 208 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LUZP4Q9P127 313 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LZTS1Q9Y250 596 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 LY75O60449 1722 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PP64 1363 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 NSD2O96028 1365 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 UTRNP46939 3433 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MEGF6O75095 1541 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 C4BP0C0L5 1744 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TMEM82A0PJX8 343 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FITM1A5D6W6 292 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HPXP02790 462 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 AMY2AP04746 511 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 DPEP1P16444 411 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 AMY2BP19961 511 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FAM193AP78312 1265 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ALFQ53S48 1182 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ABHD4Q8TB40 342 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZMAT4Q9H898 229 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RNF114Q9Y508 228 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.65□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.65□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 C7orf72A4D263 438 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 F5H423 210 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TYRP1P17643 537 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ENPP1P22413 925 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CHRNEQ04844 493 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ZPBP2Q6X784 338 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NME8Q8N427 588 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PGBD4Q96DM1 585 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 ZNF69Q9UC07 566 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 EBF1Q9UH73 591 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FLT4P35916 1363 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 A6NNZ2 444 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FAM227AF5H4B4 570 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 H3BML4 177 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SCDO00767 359 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DTNBO60941 627 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NDUFS2O75306 463 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TUSC2O75896 110 aa6.63□□□□□ -1.35
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