RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH2P05091 517 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 TXKP42681 527 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 FERMT3Q86UX7 667 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 MTMR9Q96QG7 549 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 LYPLA2O95372 231 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 KLRC2P26717 231 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 CLCN4P51793 760 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 NUBP1P53384 320 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 GUCY1B3Q02153 619 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 MTRQ99707 1265 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA1HO95180 2353 aa23.48■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 USP34Q70CQ2 3546 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 NRP1O14786 923 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ERLIN2O94905 339 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 GPR149Q86SP6 731 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 CNNM3Q8NE01 707 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.47■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 LILRB3O75022 631 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ITGA4P13612 1032 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ATP2B1P20020 1258 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.351e-10■■■■■ 34.2
SOCS1-201ENST00000332029 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 C8orf76Q96K31 380 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 IPPQ9Y573 584 aa23.46■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 TSPAN1O60635 241 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 SOD2P04179 222 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 URODP06132 367 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 AXLP30530 894 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MCM7P33993 719 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 PTENP60484 403 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 NOTUMQ6P988 496 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC51Q96ER9 411 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MARCH5Q9NX47 278 aa23.45■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 H0Y858 1186 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 C2CD2LO14523 706 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 DGAT1O75907 488 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 OR1G1P47890 313 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 TFDP1Q14186 410 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 CPB2Q96IY4 423 aa23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ARL5CA6NH57 179 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 POTEMA6NI47 508 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 INPPL1O15357 1258 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ST18O60284 1047 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MLH1P40692 756 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 GAD1Q99259 594 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 KIF2CQ99661 725 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 CSRNP2Q9H175 543 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 RNF39Q9H2S5 420 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 HES2Q9Y543 173 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ARID2Q68CP9 1835 aa23.43■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 GFRA3O60609 400 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ARL2P36404 184 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 RARRES1P49788 294 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 POU5F1BQ06416 359 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SOCS1-201ENST00000332029 MYO10Q9HD67 2058 aa23.41■■□□□ 1.34
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