RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 CEP112Q8N8E3 955 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 UBXN4Q92575 508 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 VTI1AQ96AJ9 217 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 PTPN18Q99952 460 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 K7ERI5 159 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 IER5Q5VY09 327 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 TAPT1Q6NXT6 567 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 VPS36Q86VN1 386 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB42B2RXF5 422 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 EVI5O60447 810 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 GTF2H1P32780 548 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP1Q07960 439 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 GPR142Q7Z601 462 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 TCP11Q8WWU5 503 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM8AQ9HCN3 771 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 EXTL3O43909 919 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ADCY3O60266 1144 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 MOCS3O95396 460 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 KRT39Q6A163 491 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ALS2CR12Q96Q35 445 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 NENFQ9UMX5 172 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ENC1O14682 589 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC172P0C7W6 258 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 DRP2Q13474 957 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 LAMC2Q13753 1193 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 GRB14Q14449 540 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ATP8B3O60423 1300 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF233A6NK53 670 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 NAB2Q15742 525 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 RGMBQ6NW40 437 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 GH1P01241 217 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 NOX5Q96PH1 765 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 KATNBL1Q9H079 304 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SALL4Q9UJQ4 1053 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 NAGPAQ9UK23 515 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 JRKLQ9Y4A0 524 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 HBP1O60381 514 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP44Q17R89 818 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 TRPC6Q9Y210 931 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SAR1BQ9Y6B6 198 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAPK4P31152 587 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 EFNA5P52803 228 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA1Q92805 767 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 MAP7D2Q96T17 732 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 BTNL10A8MVZ5 291 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP4BP1P59074 171 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 DPP9Q86TI2 863 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PACSIN1Q9BY11 444 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 LRRN2O75325 713 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 GPC3P51654 580 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 KIF22Q14807 665 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 SYT11Q9BT88 431 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD8-201ENST00000313173 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms