RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 SNX17Q15036 470 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 KRT31Q15323 416 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 AMHR2Q16671 573 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TOM1L1O75674 476 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ERLIN2O94905 339 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CTSHP09668 335 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 UBASH3AP57075 661 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TCHPQ9BT92 498 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 IFNKQ9P0W0 207 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CLDN3O15551 220 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FGFR4P22455 802 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 RDH13Q8NBN7 331 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ADCY5O95622 1261 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CHRNA1P02708 482 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FAM186BQ8IYM0 893 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TSPAN1O60635 241 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MGAT3Q09327 533 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 SAAL1Q96ER3 474 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 VPS16Q9H269 839 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 A0A0B4J269 797 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CAND2O75155 1236 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 COL6A1P12109 1028 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CAPN2P17655 700 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PROZP22891 400 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZNF75DP51815 510 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 GPD1LQ8N335 351 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CPB2Q96IY4 423 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CBFA2T2O43439 604 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CD4P01730 458 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TPM2P07951 284 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB33Q86T24 672 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 N4BP3O15049 544 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 MCL1Q07820 350 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FAM26DQ5JW98 314 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 BORCS6Q96GS4 357 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 FBXL18Q96ME1 805 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GTH6 734 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GUA9 196 aa24.14■■□□□ 1.45
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