RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 GCNT3O95395 438 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC34A2O95436 690 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 GGPS1O95749 300 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TTLL1O95922 423 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT16P08779 473 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 DPEP1P16444 411 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CCND1P24385 295 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 COPS2P61201 443 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SATB1Q01826 763 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 GRIK3Q13003 919 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CBWD6Q4V339 395 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC38Q502W7 563 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CD209Q9NNX6 404 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SIPA1L1O43166 1804 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 A8MUI8 341 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CCNG1P51959 295 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 FITM2Q8N6M3 262 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TTLL6Q8N841 843 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ERMNQ8TAM6 284 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CD101Q93033 1021 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 AAASQ9NRG9 546 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 GGT7Q9UJ14 662 aa9.13□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM120BA0PK00 339 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 MEIS2O14770 477 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RIMBP2O15034 1052 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SUN1O94901 812 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CCNB1P14635 433 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 IL1R1P14778 569 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CREB1P16220 341 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNA3P22001 575 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC14Q15048 493 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP2R5AQ15172 486 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 Q4G0T1 1027 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CGB2Q6NT52 195 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 LMO3Q8TAP4 145 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 USP40Q9NVE5 1235 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 VAV3Q9UKW4 847 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 DIAPH2O60879 1101 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 MTA2O94776 668 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFAIP3P21580 790 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 MSH2P43246 934 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGAP4P98171 946 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 AP3B2Q13367 1082 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 LONRF1Q17RB8 773 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 KCTD1Q719H9 257 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ERICH1Q86X53 443 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 KLHL29Q96CT2 875 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SERPINB12Q96P63 405 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 FIZ1Q96SL8 496 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 AGPAT1Q99943 283 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBQLN3-201ENST00000311659 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms