RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 TMX1Q9H3N1 280 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PANK4Q9NVE7 773 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.09□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.08□□□□□ -0.31
C16orf46-201ENST00000299578 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FRMD3A2A2Y4 597 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 H0YCG3 227 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 K7ENM7 598 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PRKCBP05771 671 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TPM2P07951 284 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NCKAP1LP55160 1127 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 LRMPQ12912 555 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 COASYQ13057 564 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CUL4BQ13620 913 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SHHQ15465 462 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 MAPK6Q16659 721 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FAM178BQ8IXR5 827 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC113Q9H0I3 377 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PRO3102Q9H379 93 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TTC3P53804 2025 aa13.08□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 DENND3A2RUS2 1198 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 K7ERI5 159 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TSPAN1O60635 241 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ATP1A3P13637 1013 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF18P17022 549 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 KCNJ6P48051 423 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 AMHR2Q16671 573 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FAM187BQ17R55 369 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA1Q5VX52 437 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 UNC13DQ70J99 1090 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TMC6Q7Z403 805 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TDHQ8IZJ6 230 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 GBF1Q92538 1859 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FZD8Q9H461 694 aa13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 B4GALT5O43286 388 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 MGEA5O60502 916 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 AXLP30530 894 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 RASIP1Q5U651 963 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 HAUS6Q7Z4H7 955 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 FIZ1Q96SL8 496 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ADAM2Q99965 735 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CHST12Q9NRB3 414 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 KCND1Q9NSA2 647 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ACKR2O00590 384 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 AMHP03971 560 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SKILP12757 684 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 SCP2P22307 547 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ABCD1P33897 745 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 STRN3Q13033 797 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 DSC3Q14574 896 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 KCNB1Q14721 858 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 NOTUMQ6P988 496 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 CPB2Q96IY4 423 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 EXOC1Q9NV70 894 aa13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.05□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 ENPP3O14638 875 aa13.05□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 KLRC4O43908 158 aa13.05□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 EDN1P05305 212 aa13.05□□□□□ -0.32
C16orf46-201ENST00000299578 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms