RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 RNF39Q9H2S5 420 aa21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.82■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 KLRC2P26717 231 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ARL2P36404 184 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 RARRES1P49788 294 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC51Q96ER9 411 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR9Q96QG7 549 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 GAD1Q99259 594 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CSRNP2Q9H175 543 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 HES2Q9Y543 173 aa21.81■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WWV3 80 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ARL5CA6NH57 179 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 LILRB3O75022 631 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MLH1P40692 756 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CLCN4P51793 760 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR3Q13615 1198 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PRRX2Q99811 253 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MARCH5Q9NX47 278 aa21.8■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 POTEMA6NI47 508 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 INPPL1O15357 1258 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 BRD1O95696 1058 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SOD2P04179 222 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 GLRA2P23416 452 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 OR1G1P47890 313 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SCNN1GP51170 649 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN5P54829 565 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 AMHR2Q16671 573 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ZFP42Q96MM3 310 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 APOL6Q9BWW8 343 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MIOSQ9NXC5 875 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 USTQ9Y2C2 406 aa21.79■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 C2CD2LO14523 706 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 URODP06132 367 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2B1P20020 1258 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 AVPR2P30518 371 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 DSC1Q08554 894 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ST3GAL1Q11201 340 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 GPR149Q86SP6 731 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.78■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 B4GALT5O43286 388 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 ASGR2P07307 311 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MCM7P33993 719 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TCF15Q12870 199 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 HACE1Q8IYU2 909 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 PHOX2BQ99453 314 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.77■■□□□ 1.08
CXCL3-201ENST00000296026 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 GUCY1B3Q02153 619 aa21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 MYO10Q9HD67 2058 aa21.76■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 PIEZO1Q92508 2521 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 F8W810 466 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 NR1I2O75469 434 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 NPTXRO95502 500 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 EFEMP2O95967 443 aa21.75■■□□□ 1.07
CXCL3-201ENST00000296026 AKAP5P24588 427 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms