RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.33■■□□□ 1.33
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SNRNP25-201ENST00000293861 PIGRP01833 764 aa23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 GLRA2P23416 452 aa23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 KLRC1P26715 233 aa23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF2H1P32780 548 aa23.33■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ARMCX2Q7L311 632 aa23.33■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 SAAL1Q96ER3 474 aa23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SYT11Q9BT88 431 aa23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ADORA2AP29274 412 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM143Q96AN5 459 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.32■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 SLC26A2P50443 739 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CLCN6P51797 869 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP24A1Q07973 514 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF22Q14807 665 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT39Q6A163 491 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 GLG1Q92896 1179 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA33Q96N06 139 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TSKSQ9UJT2 592 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.323e-24■■■■□ 22.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 STRN3Q13033 797 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 VTA1Q9NP79 307 aa23.31■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SRGAP2O75044 1071 aa23.3■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.3■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 BICD1Q96G01 975 aa23.3■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.3■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 BUB1O43683 1085 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 LIG4P49917 911 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 DEPTORQ8TB45 409 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 GPC3P51654 580 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 MMS19Q96T76 1030 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 EPC1Q9H2F5 836 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.29■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF233A6NK53 670 aa23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 K7ERI5 159 aa23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TLR10Q9BXR5 811 aa23.28■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.28■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.27■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 H2AFZP0C0S5 128 aa23.27■■□□□ 1.32
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SNRNP25-201ENST00000293861 CLDN10P78369 228 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 ITIH3Q06033 890 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 IER5Q5VY09 327 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 H2AFVQ71UI9 128 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CREG2Q8IUH2 290 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TCP11Q8WWU5 503 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPN18Q99952 460 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB21Q9UL25 225 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PALMO75781 387 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 GRB14Q14449 540 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PLCB4Q15147 1175 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 GPR142Q7Z601 462 aa23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SNRNP25-201ENST00000293861 COPS5Q92905 334 aa23.27■■□□□ 1.32
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