RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.222e-12■■■□□ 18.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 TUBBP07437 444 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNA2P16389 499 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKCEQ02156 737 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNX1Q13596 522 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBX20Q9UMR3 447 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.65■■□□□ 1.22
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UBE2Q1-201ENST00000292211 OTUD5Q96G74 571 aa22.65■■□□□ 1.22
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UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKCIP41743 596 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 MXI1P50539 228 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASP8Q14790 479 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR78Q5VTH9 848 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.228e-6■■□□□ 11.7
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UBE2Q1-201ENST00000292211 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 L1RE1Q9UN81 338 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP20Q9Y2K6 914 aa22.64■■□□□ 1.22
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UBE2Q1-201ENST00000292211 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MCM3P25205 808 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 FSTL1Q12841 308 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS6KA1Q15418 735 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRLRP16471 622 aa22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 STXBP2Q15833 593 aa22.63■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ELP3Q9H9T3 547 aa22.63■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 GALCP54803 685 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 INHBEP58166 350 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 C8orf74Q6P047 294 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR93Q6P2C0 686 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFT74Q96LB3 600 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIPINQ9BVW5 301 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIFAP3Q92845 792 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADRB2P07550 413 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 PEX26Q7Z412 305 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SP2Q02086 613 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MOB2Q70IA6 237 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 RDM1Q8NG50 284 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 KAT5Q92993 513 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM143Q96AN5 459 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCLT1Q96NL6 688 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYBPC2Q14324 1141 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 CABS1Q96KC9 395 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.61■■□□□ 1.21
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