RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 PPFIA2O75334 1257 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RNF8O76064 485 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CYP11B2P19099 503 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SKOR1P84550 965 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.75■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TRAPPC3O43617 180 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FSBPO95073 299 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CNGA1P29973 690 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ZBTB33Q86T24 672 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ACP6Q9NPH0 428 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ADAMTS3O15072 1205 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ENO1P06733 434 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ATP2B4P23634 1241 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ARSEP51690 589 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 KLC1Q07866 573 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 KCNA1Q09470 495 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 P3H1Q32P28 736 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FIGNQ5HY92 759 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 MED24O75448 989 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CCND1P24385 295 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SERPINB4P48594 390 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 HSPH1Q92598 858 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 IL17RBQ9NRM6 502 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SPATA20Q8TB22 786 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 AGAP11Q8TF27 550 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SNF8Q96H20 258 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 IWS1Q96ST2 819 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 STK33Q9BYT3 514 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.74■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 F5H6K3 240 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PDXKO00764 312 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 KLRC3Q07444 240 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 IQCKQ8N0W5 287 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FGD4Q96M96 766 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TRPC6Q9Y210 931 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CRYMQ14894 314 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 BRINP3Q76B58 766 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ATP2A3Q93084 1043 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CDH16O75309 829 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SLURP2P0DP57 97 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 MTERF2Q49AM1 385 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RUBCNQ92622 972 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 SH3GL3Q99963 347 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 GDF3Q9NR23 364 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 HEY1Q9Y5J3 304 aa16.73■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 FGFR2P21802 821 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PGM1P36871 562 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 COG2Q14746 738 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 MIEF2Q96C03 454 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 E2F8A0AVK6 867 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.72■□□□□ 0.27
USP43-201ENST00000285199 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms