RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D8O95759 1140 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT13P13646 458 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FCGRTP55899 365 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 HGSNATQ68CP4 663 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 GJB7Q6PEY0 223 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIB2Q92519 343 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CREBZFQ9NS37 354 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 COL1A2P08123 1366 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP350Q5VT06 3117 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFA10O95299 355 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 F2P00734 622 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCF3P0C7M6 154 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TNNT1P13805 278 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 GCLMP48507 274 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 EFNA5P52803 228 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT7BP56706 349 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN14Q15678 1187 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 GPD1LQ8N335 351 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MINDY3Q9H8M7 445 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0B4J269 797 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCGO15287 622 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN12O43309 604 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ABL1P00519 1130 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC175P0C221 793 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FLT3LGP49771 235 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP24A1Q07973 514 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIK4Q16099 956 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP4Q96MN2 994 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ABLIM1O14639 778 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PTENP60484 403 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MYL7Q01449 175 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCZQ05513 592 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PPFIA1Q13136 1202 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF263O14978 683 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEB2O15479 319 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 EXTL3O43909 919 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM189A1O60320 539 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT2P49753 483 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 BEX3Q00994 111 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 HIC1Q14526 733 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZPBP2Q6X784 338 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD8Q9H461 694 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CCP110O43303 1012 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CYBAP13498 195 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 APLP1P51693 650 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 JAM2P57087 298 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 EPC2Q52LR7 807 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCEQ6IPM2 695 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TMC2Q8TDI7 906 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM84AQ96KN4 292 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 SETD4Q9NVD3 440 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 Q9Y3F1 56 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PMM2O15305 246 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ASAP2O43150 1006 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 VTNP04004 478 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM32Q13049 653 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK6Q16659 721 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALT5O43286 388 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCBP05771 671 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP25P42331 645 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN10P78369 228 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms