RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 SMRP1Q8NCR6 262 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 KIFAP3Q92845 792 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 CD207Q9UJ71 328 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 DNM3Q9UQ16 869 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 HES2Q9Y543 173 aa24.6■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 E9PMD0 336 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 SLC11A1P49279 550 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 PPP2R5AQ15172 486 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 TMC7Q7Z402 723 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 BRAPQ7Z569 592 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 IRAK3Q9Y616 596 aa24.59■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 ARL5CA6NH57 179 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 ZP2Q05996 745 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 KCNK18Q7Z418 384 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 GAD1Q99259 594 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 ZBP1Q9H171 429 aa24.58■■□□□ 1.53
PRADC1-201ENST00000258083 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 C19orf67A6NJJ6 358 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ACKR2O00590 384 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 POMCP01189 267 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 DSC1Q08554 894 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 CLUL1Q15846 466 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 MAPK6Q16659 721 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 DAW1Q8N136 415 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 GJD3Q8N144 294 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 PNMA5Q96PV4 448 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 EDN1P05305 212 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 CTSAP10619 480 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 MLH1P40692 756 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 EFNA5P52803 228 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 HACE1Q8IYU2 909 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 VPS52Q8N1B4 723 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 DEPTORQ8TB45 409 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 IFT74Q96LB3 600 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ZFP42Q96MM3 310 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 GBP3Q9H0R5 595 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 POLD4Q9HCU8 107 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 MIOSQ9NXC5 875 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 STK39Q9UEW8 545 aa24.56■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 NPTXRO95502 500 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 EFEMP2O95967 443 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 BMP15O95972 392 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ALDH2P05091 517 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 PRKCBP05771 671 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 PDCP20941 246 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 MAPK7Q13164 816 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 AK8Q96MA6 479 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.55■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 NRP1O14786 923 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 N4BP3O15049 544 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 SLC26A4O43511 780 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 GUCY2CP25092 1073 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 SCNN1GP51170 649 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 TIPINQ9BVW5 301 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 MARCH5Q9NX47 278 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.54■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 AKAP5P24588 427 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 GIT2Q14161 759 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 SUSD6Q92537 303 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 APOL6Q9BWW8 343 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.53■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 HIP1RO75146 1068 aa24.52■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 CXCL14O95715 111 aa24.52■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 NPTX2P47972 431 aa24.52■■□□□ 1.52
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD54Q6NXT1 300 aa24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms