RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp17laQ61068 526 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AlcamQ61490 583 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nrg1Q6DR99 700 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Reps2Q80XA6 521 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map3k11Q80XI6 850 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phldb2Q8K1N2 1249 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ablim1Q8K4G5 861 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr532Q8VGT4 309 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp6v0a4Q920R6 833 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spata31d1aE9QA35 1336 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Irs2P81122 1321 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CluhQ5SW19 1315 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klhdc7aA2APT9 773 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r121A2BE32 847 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pbx3O35317 434 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PargO88622 969 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt14Q61781 484 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asic1Q6NXK8 526 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Herc4Q6PAV2 1057 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kctd12bQ8C7J6 292 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 BrdtQ91Y44 956 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olig1Q9JKN5 260 aa21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ca3P16015 260 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wnt7bP28047 349 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cxcl12P40224 93 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtf2bP62915 316 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtprcapQ64697 197 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Proser3Q7TSA6 634 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankfy1Q810B6 1169 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Susd6Q8BGE4 302 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rec8Q8C5S7 591 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cnga3Q9JJZ8 631 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl2c5Q9JLV9 222 aa21.58■■□□□ 1.05
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zscan29E9Q5B4 869 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nptx2O70340 429 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nol4P60954 483 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr538Q7TRT5 310 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc122Q8BVN0 290 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phka2Q8BWJ3 1235 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccser1Q8C0C4 895 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ildr1Q8CBR1 537 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Git2Q9JLQ2 708 aa21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp8b5A3FIN4 1183 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hcn4O70507 1186 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dpep1P31428 410 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ercc5P35689 1170 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gas2l3Q3UWW6 683 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Snx25Q3ZT31 840 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr392Q7TRX6 312 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpatch3Q8BIY1 525 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clec1aQ8BWY2 269 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem161bQ8C2L6 487 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TnmdQ9EP64 317 aa21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col6a3E9PWQ3 3284 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Herc3A6H6S0 1050 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp472B0V2W5 534 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acad12D3Z7X0 555 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm11236J3QMS7 360 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MybP06876 636 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stat5aP42230 793 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf354cQ571J5 560 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp13Q5BKP2 858 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pnma2Q8BHK0 365 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif2bQ8C0N1 668 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 VillQ91YD6 859 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fuca1Q99LJ1 452 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Med10Q9CXU0 135 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 QpctQ9CYK2 362 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pramef12Q9D2F1 463 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Noxred1Q9D3S5 366 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc105Q9D4K7 499 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajb4Q9D832 337 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Doc2gQ9ESN1 387 aa21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700001O22RikA2APZ1 375 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mmrn2A6H6E2 943 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnt2D3Z649 1135 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dennd1bQ3U1T9 766 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Oog4Q4G0C7 502 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdc37Q61081 379 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr44Q6NVE8 915 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Naa30Q8CES0 364 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekhh3Q8VCE9 796 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Necab2Q91ZP9 389 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plagl2Q925T4 496 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AmfrQ9R049 643 aa21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms