RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 BSNDQ8WZ55 320 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 PNMA5Q96PV4 448 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 CSRNP2Q9H175 543 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 RSAD1Q9HA92 442 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 CLIC4Q9Y696 253 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.72■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 SLC26A4O43511 780 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 FGF18O76093 207 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 PPM1AP35813 382 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 KCNK18Q7Z418 384 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 HACE1Q8IYU2 909 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 URGCPQ8TCY9 931 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 ASB2Q96Q27 587 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 B4GALT5O43286 388 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 OFD1O75665 1012 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 ITGA4P13612 1032 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 LIG1P18858 919 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 TFF2Q03403 129 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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SYT6-210ENST00000641643 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 DRC1Q96MC2 740 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 FZD8Q9H461 694 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 IPPQ9Y573 584 aa24.71■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.7■■□□□ 1.55
SYT6-210ENST00000641643 A0A1B0GUA9 196 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 KRT17Q04695 432 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 FAM187BQ17R55 369 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 TIPINQ9BVW5 301 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.7■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 CARNS1A5YM72 827 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 CCDC169A6NNP5 214 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 HIP1RO75146 1068 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 PRKCBP05771 671 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 PLA2G4BP0C869 781 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 DNAJB1P25685 340 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 TLR9Q9NR96 1032 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.69■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 DLL1O00548 723 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 NCK2O43639 380 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 PLCB3Q01970 1234 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 GRIN1Q05586 938 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 PTPAQ15257 358 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.68■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.68■■□□□ 1.54
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SYT6-210ENST00000641643 KCND2Q9NZV8 630 aa24.68■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 ACKR2O00590 384 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 NPTXRO95502 500 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 PEX3P56589 373 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 BCAR1P56945 870 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 APOL6Q9BWW8 343 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 GBP3Q9H0R5 595 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 LZTS1Q9Y250 596 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 HES2Q9Y543 173 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 K7ERI5 159 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 GUCY2CP25092 1073 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 SLC12A3P55017 1021 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.67■■□□□ 1.54
SYT6-210ENST00000641643 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.67■■□□□ 1.54
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