RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ERP44	Q9BS26	406 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ASB3	Q9Y575	518 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36	6e-7	■■■■■ 30.6
NECAP1-222	ENST00000640072	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC160	A6NGH7	325 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PLOD2	O00469	737 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KRIT1	O00522	736 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PLOD3	O60568	738 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PFKFB2	O60825	505 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	HSPA4L	O95757	839 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NR1D1	P20393	614 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ECE1	P42892	770 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ACADSB	P45954	432 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MMEL1	Q495T6	779 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PEX13	Q92968	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SUCLG2	Q96I99	432 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TBATA	Q96M53	351 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	COQ7	Q99807	217 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SH3GL2	Q99962	352 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GAL3ST1	Q99999	423 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CENPK	Q9BS16	269 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	EHD1	Q9H4M9	534 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM206	Q9H813	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LY9	Q9HBG7	655 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PANK4	Q9NVE7	773 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GMNC	A6NCL1	334 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SNPH	O15079	494 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIM27	P14373	513 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NLRP6	P59044	892 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	E2F2	Q14209	437 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TTC22	Q5TAA0	569 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ANO7	Q6IWH7	933 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PALM2	Q8IXS6	379 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SCAI	Q8N9R8	606 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	JAG2	Q9Y219	1238 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	TNFRSF10A	O00220	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ALOX5	P09917	674 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	THEGL	P0DJG4	465 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	HPGD	P15428	266 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	GJB2	P29033	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PCP4	P48539	62 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINB8	P50452	374 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD23B	P54727	409 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	COG7	P83436	770 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CUL2	Q13617	745 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	SSPN	Q14714	243 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	VEPH1	Q14D04	833 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	MOG	Q16653	247 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR93	Q6P2C0	686 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	PJA1	Q8NG27	643 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	IFT81	Q8WYA0	676 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF566	Q969W8	418 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NECAP1-222	ENST00000640072	KLHL29	Q96CT2	875 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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