RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 HIPK3Q9H422 1215 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.68□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 BICDL2A1A5D9 508 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KIAA0355O15063 1070 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ERLIN2O94905 339 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 IQCF3P0C7M6 154 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CCNE1P24864 410 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PAK1Q13153 545 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 AMHR2Q16671 573 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CENPPQ6IPU0 288 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ZPBP2Q6X784 338 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NELFBQ8WX92 580 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 P2RX5Q93086 422 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 BICD1Q96G01 975 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 GBP3Q9H0R5 595 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TSPY26PQ9H489 355 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PDXKO00764 312 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 GPR182O15218 404 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TSPAN1O60635 241 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 RPS6KA5O75582 802 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 LIG4P49917 911 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRC63Q05C16 580 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 LPIN1Q14693 890 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM228AQ86W67 206 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TSG101Q99816 390 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.66□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 B4GALT5O43286 388 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TGFB1I1O43294 461 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 EDN1P05305 212 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 GHRP10912 638 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 AXLP30530 894 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PAK2Q13177 524 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 MBTPS1Q14703 1052 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 NFIL3Q16649 462 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 EVPLQ92817 2033 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA4-216ENST00000636652 SIP14410 1827 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 N4BP3O15049 544 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TOM1L1O75674 476 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TIMP1P01033 207 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 FGFR4P22455 802 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CYP2C18P33260 490 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 RFC2P35250 354 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF165P49910 485 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 MYBPC2Q14324 1141 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TTI2Q6NXR4 508 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC51Q96ER9 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA4-216ENST00000636652 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms