RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 GAAP10253 952 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 ITGB5P18084 799 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC16A1P53985 500 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 DLG4P78352 724 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA0753Q2KHM9 967 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 VMACQ2NL98 169 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC149Q6ZUS6 474 aa2.85□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 SH2D3CQ8N5H7 860 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 REPS2Q8NFH8 660 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 OR5AN1Q8NGI8 311 aa2.85□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 PLBD2Q8NHP8 589 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 CCHCR1Q8TD31 782 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 RSAD2Q8WXG1 361 aa2.85□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa2.85□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 PSMD1Q99460 953 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 BHMT2Q9H2M3 363 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 SIK3Q9Y2K2 1263 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa2.85□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PMM2O15305 246 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 ADCY6O43306 1168 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 B3GALT2O43825 422 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PLIN1O60240 522 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PRAMEF4O60810 478 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 KLHL18O94889 574 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 LDHAP00338 332 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 HTR1BP28222 390 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 PER3P56645 1201 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC157Q569K6 752 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 PWWP2AQ96N64 755 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 TBCBQ99426 244 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 ARPC5LQ9BPX5 153 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 C7orf25Q9BPX7 421 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 B3GNT5Q9BYG0 378 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 STAP2Q9UGK3 403 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 L1RE1Q9UN81 338 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 NR2E3Q9Y5X4 410 aa2.84□□□□□ -1.95
SPTAN1-232ENST00000636483 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa2.84□□□□□ -1.95
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SPTAN1-232ENST00000636483 H3BML4 177 aa2.83□□□□□ -1.96
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SPTAN1-232ENST00000636483 NRP2O60462 931 aa2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 FSBPO95073 299 aa2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBED1O96006 694 aa2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 FTLP02792 175 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 AMY1AP04745 511 aa2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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