RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635963.1

EFHC1-211, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EFHC1, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-211ENST00000635963 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ZBP1Q9H171 429 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.63□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 A0A087WWV3 80 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 GPR37L1O60883 481 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RPA1P27694 616 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NBR1Q14596 966 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RABEP1Q15276 862 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 LONRF3Q496Y0 759 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TTC38Q5R3I4 469 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 POTEGQ6S5H5 508 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CCDC51Q96ER9 411 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 S1PR5Q9H228 398 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 DDHD2O94830 711 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 EFEMP2O95967 443 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 GALTP07902 379 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ATP2B1P20020 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 AXLP30530 894 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SLC11A1P49279 550 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ZNF174Q15697 407 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PGBD4Q96DM1 585 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 IGSF21Q96ID5 467 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RSAD1Q9HA92 442 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 IPPQ9Y573 584 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 IRAK3Q9Y616 596 aa14.61□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CARNS1A5YM72 827 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 B4GALT5O43286 388 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MUTP22033 750 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TECP42680 631 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 KRT17Q04695 432 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TFDP1Q14186 410 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ECM1Q16610 540 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NOTUMQ6P988 496 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 BSNDQ8WZ55 320 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CPB2Q96IY4 423 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CSRNP2Q9H175 543 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RNF39Q9H2S5 420 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.6□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PLXNA3P51805 1871 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ERLIN2O94905 339 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CTSAP10619 480 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 DSC1Q08554 894 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 FAM187BQ17R55 369 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TMC7Q7Z402 723 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CNNM3Q8NE01 707 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TMEM169Q96HH4 297 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 NACC1Q96RE7 527 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 MARCH5Q9NX47 278 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-211ENST00000635963 A0A1B0GUA9 196 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 DCXO43602 365 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 LILRB3O75022 631 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 EDN1P05305 212 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 PTPN14Q15678 1187 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 IL17AQ16552 155 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-211ENST00000635963 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms