RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.89	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYH6	P13533	1939 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC169	A6NNP5	214 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SPTLC2	O15270	562 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	AHCYL1	O43865	530 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB	P07437	444 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP25	P42331	645 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF165	P49910	485 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT76	Q01546	638 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA21	Q7Z572	469 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MFN1	Q8IWA4	741 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PCYT2	Q99447	389 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	APOL6	Q9BWW8	343 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO7A	Q13402	2215 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ARVCF	O00192	962 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD10	O75832	226 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT85	P78386	507 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NAA25	Q14CX7	972 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IL17A	Q16552	155 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0754	O94854	1291 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ECEL1	O95672	775 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FES	P07332	822 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SMTN	P53814	917 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ECM1	Q16610	540 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CABP7	Q86V35	215 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB34	Q9BZG1	259 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KLC4	Q9NSK0	619 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf42	Q9H799	3197 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CLTB	P09497	229 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC8A1	P32418	973 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMK4	Q16566	473 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK18	Q7Z418	384 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ERMN	Q8TAM6	284 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SPDL1	Q96EA4	605 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TNMD	Q9H2S6	317 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB21	Q9UL25	225 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RLF	Q13129	1914 aa		7.87	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	STAM2	O75886	525 aa		7.86	□□□□□ -1.15

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