RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 PARP14Q460N5 1801 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 DAAM2Q86T65 1068 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 USP20Q9Y2K6 914 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.91■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 AGPAT1Q99943 283 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 DENND3A2RUS2 1198 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 LRRN2O75325 713 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 DGAT1O75907 488 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 USP37Q86T82 979 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 KRT12Q99456 494 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 GDF3Q9NR23 364 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 GGA3Q9NZ52 723 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.9■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 ANKRD62A6NC57 917 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 CEP104O60308 925 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 CNGA1P29973 690 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 ABCD1P33897 745 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 CAVIN3Q969G5 261 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 AMFRQ9UKV5 643 aa22.89■■□□□ 1.26
CPEB1-218ENST00000620182 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RTP1P59025 263 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 NNTQ13423 1086 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 HINFPQ9BQA5 517 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 FZD1Q9UP38 647 aa22.89■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF862O60290 1169 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RGS20O76081 388 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 H0YCG3 227 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ADRB2P07550 413 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ADSSP30520 456 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GYS2P54840 703 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 PAK2Q13177 524 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 METTL13Q8N6R0 699 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.253e-7■□□□□ 9.7
CPEB1-218ENST00000620182 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.88■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 STBD1O95210 358 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ABCB4P21439 1286 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 KRT39Q6A163 491 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 HES6Q96HZ4 224 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC66A2RUB6 948 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GLTPD2A6NH11 291 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GLI1P08151 1106 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ACTR2P61160 394 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 TMC2Q8TDI7 906 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SCFD2Q8WU76 684 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 IFT74Q96LB3 600 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RLFQ13129 1914 aa22.86■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 CCDC188H7C350 402 aa22.86■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 RNF40O75150 1001 aa22.86■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 MFAP3P55082 362 aa22.86■■□□□ 1.25
CPEB1-218ENST00000620182 GUCY2DQ02846 1103 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms