RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611174.4

CENPE-208, Transcript of centromere protein E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CENPE, Length 8,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPE-208ENST00000611174 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 CCND2P30279 289 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 MSH2P43246 934 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 FMO5P49326 533 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 IL9RQ01113 521 aa5.06□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 ARL4AP40617 200 aa5.06□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 CCT6BQ92526 530 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ACAD9Q9H845 621 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 GGA3Q9NZ52 723 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 E9PCH4 1651 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 A0A0U1RQJ8 604 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 GSTA1P08263 222 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 GSTA2P09210 222 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 WEE2P0C1S8 567 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ZNF699Q32M78 642 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.06□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 A0A0G2JND7 137 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 GNA15P30679 374 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SOX5P35711 763 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 MAP2K2P36507 400 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 RGS7P49802 495 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SLMAPQ14BN4 828 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ALS2CLQ60I27 953 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 CENPPQ6IPU0 288 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 10.3
CENPE-208ENST00000611174 SIK2Q9H0K1 926 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SNX25Q9H3E2 840 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 FEM1BQ9UK73 627 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 NFIBO00712 420 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 CIB2O75838 187 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 DPEP1P16444 411 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ABI1Q8IZP0 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 INTUQ9ULD6 942 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 UNC13BO14795 1591 aa5.05□□□□□ -1.6
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CENPE-208ENST00000611174 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CENPE-208ENST00000611174 FGFR4P22455 802 aa5.05□□□□□ -1.6
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