RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCN4P51793 760 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 INF2Q27J81 1249 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 LETM2Q2VYF4 491 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR149Q86SP6 731 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP170P1Q96L14 293 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM20AQ96MK3 541 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM175Q9BSA9 504 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 RSAD1Q9HA92 442 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 PPME1Q9Y570 386 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-226ENST00000593200 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 LILRB3O75022 631 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH2P05091 517 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 KLRC2P26717 231 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RFC5P40937 340 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCN5P51795 746 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 UBXN11Q5T124 520 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NEK8Q86SG6 692 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf19Q8IY42 314 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM143Q96AN5 459 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX27Q96L92 541 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NRP1O14786 923 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 POMCP01189 267 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SOD2P04179 222 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 NBL1P41271 181 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 STK3Q13188 491 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF149Q8NC42 400 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 HAS1Q92839 578 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 LXNQ9BS40 222 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCH5Q9NX47 278 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TBX3O15119 743 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 INPPL1O15357 1258 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 ASAP2O43150 1006 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 URODP06132 367 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TDGQ13569 410 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EMC2Q15006 297 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 EPHA7Q15375 998 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 FERMT3Q86UX7 667 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CNNM3Q8NE01 707 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TCP11Q8WWU5 503 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNK12Q9HB15 430 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-226ENST00000593200 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms