RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	BICD1	Q96G01	975 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLIC2	O15247	247 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKCB	P05771	671 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSG101	Q99816	390 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FZD8	Q9H461	694 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRNA1	P02708	482 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACKR2	O00590	384 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	B4GALT5	O43286	388 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGFR4	P22455	802 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NR2F2	P24468	414 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADSS	P30520	456 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNX17	Q15036	470 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0QZ92	97 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD4	P01730	458 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NR3C1	P04150	777 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIG4	P49917	911 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMHR2	Q16671	573 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLE2	Q04725	743 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAM9	Q13443	819 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIGR	P01833	764 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CKB	P12277	381 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2J2	P51589	502 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	MGAT3	Q09327	533 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERLIN2	O94905	339 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF18	P17022	549 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CETN3	O15182	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPAN1	O60635	241 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	SI	P14410	1827 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.02	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms