RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 GANQ9H2C0 597 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FMO5P49326 533 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LIG4P49917 911 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZPBP2Q6X784 338 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 P4HA2O15460 535 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 F2P00734 622 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRC1P26715 233 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PON1P27169 355 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 VAMP7P51809 220 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR59Q6PJI9 974 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 GPD1LQ8N335 351 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TMC2Q8TDI7 906 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 BICD1Q96G01 975 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRQQ9UN88 632 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ADRB2P07550 413 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1A1P14550 325 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2K2P36507 400 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CPT1AP50416 773 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SP3Q02447 781 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PDXDC1Q6P996 788 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPV1Q8NER1 839 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 USP27XA6NNY8 438 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 HAS3O00219 553 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN12O43309 604 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 EXTL3O43909 919 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MSCO60682 206 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OFD1O75665 1012 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CYBAP13498 195 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FLT3LGP49771 235 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PTENP60484 403 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NKX3-2P78367 333 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PPFIA1Q13136 1202 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIK4Q16099 956 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RDH13Q8NBN7 331 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF149Q8NC42 400 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KAT2BQ92831 832 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FZD8Q9H461 694 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO6Q9UM54 1294 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 USP20Q9Y2K6 914 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9A1P19634 815 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2H1P32780 548 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CLCN3P51790 818 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF22Q14807 665 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIB2Q92519 343 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SIX2Q9NPC8 291 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0B4J269 797 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D8O95759 1140 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 EDN1P05305 212 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM49P0CI25 452 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM49CP0CI26 452 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TMOD1P28289 359 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IGBP1P78318 339 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL7Q01449 175 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP24A1Q07973 514 aa24.79■■□□□ 1.56
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