RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 C9IYK1 514 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TSPAN1O60635 241 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SLFN14P0C7P3 912 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 EFNA5P52803 228 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 RABGGTBP53611 331 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TYRO3Q06418 890 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 GIT2Q14161 759 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 AMHR2Q16671 573 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 LRCH3Q96II8 777 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.19■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MSRAQ9UJ68 235 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MYO9BQ13459 2157 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC169A6NNP5 214 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SFI1A8K8P3 1242 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TLL1O43897 1013 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DNAJB2P25686 324 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 AXLP30530 894 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF131P52739 623 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MAPK6Q16659 721 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FAM187BQ17R55 369 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DDX12PQ92771 950 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FZD8Q9H461 694 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PARVGQ9HBI0 331 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MYMKA6NI61 221 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FAM13AO94988 1023 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 UPP2O95045 317 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 STAG3L1P0CL83 205 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PBX2P40425 430 aa22.17■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 RAD9AQ99638 391 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.17■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 NOTUMQ6P988 496 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC51Q96ER9 411 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 INSL6Q9Y581 213 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 COL4A6Q14031 1691 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 A0A0U1RQF3 1178 aa22.16■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 FAM189BP81408 668 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 POSTNQ15063 836 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DYMQ7RTS9 669 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TIFAQ96CG3 184 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 YME1L1Q96TA2 773 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 RBSNQ9H1K0 784 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.16■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 B4GALT5O43286 388 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CAVIN2O95810 425 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 RAB27AP51159 221 aa22.15■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 MYCT1Q8N699 235 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.15■■□□□ 1.14
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ATG4D-208ENST00000588667 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 H0YCG3 227 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 K7ERI5 159 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ACKR2O00590 384 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SLC16A4O15374 487 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SKIP12755 728 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 MYOGP15173 224 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.14■■□□□ 1.14
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