RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.3■□□□□ 0.2
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CTIF-205ENST00000587860 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.29e-61■■■■■ 50.8
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CTIF-205ENST00000587860 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.29■□□□□ 0.2
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CTIF-205ENST00000587860 USP38Q8NB14 1042 aa16.28■□□□□ 0.2
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CTIF-205ENST00000587860 GAP43P17677 238 aa16.28■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
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CTIF-205ENST00000587860 BFSP1Q12934 665 aa16.28■□□□□ 0.2
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CTIF-205ENST00000587860 E2F5Q15329 346 aa16.27■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.27■□□□□ 0.19
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CTIF-205ENST00000587860 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 JDP2Q8WYK2 163 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 SH3GL3Q99963 347 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
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CTIF-205ENST00000587860 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 FSTL1Q12841 308 aa16.25■□□□□ 0.19
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