RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584051.1

CPD-208, Transcript of carboxypeptidase D, human

TSL 5

Gene CPD, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPD-208	ENST00000584051	ZNF124	Q15973	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	KCNN1	Q92952	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	GREM2	Q9H772	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CPD-208	ENST00000584051		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PEX10	O60683	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KRT1	P04264	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MPO	P05164	745 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	LCP1	P13796	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	NTRK3	Q16288	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051		Q7L0L9	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MGAM	O43451	1857 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	HRK	O00198	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PDHX	O00330	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	FUCA1	P04066	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CTGF	P29279	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CHRND	Q07001	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	2e-7	■■■■□ 25.2
CPD-208	ENST00000584051	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	CXCL11	O14625	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	KLRK1	P26718	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPD-208	ENST00000584051	VIPR1	P32241	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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