RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NAA35	Q5VZE5	725 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	COG5	Q9UP83	839 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SAMM50	Q9Y512	469 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ALG6	Q9Y672	507 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1F	O00160	1098 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GGPS1	O95749	300 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FAM107A	O95990	144 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ASNS	P08243	561 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GZMA	P12544	262 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2B	Q00403	316 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DUPD1	Q68J44	220 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NLRP14	Q86W24	1093 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PALB2	Q86YC2	1186 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DPH5	Q9H2P9	285 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	INPP5B	P32019	993 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DLG4	P78352	724 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GHRHR	Q02643	423 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PPP3CA	Q08209	521 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ODF2	Q5BJF6	829 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FAM83A	Q86UY5	434 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MTA2	O94776	668 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	VCAM1	P19320	739 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA3	P32297	505 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FLT3	P36888	993 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MXI1	P50539	228 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CDR1	P51861	262 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TKFC	Q3LXA3	575 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GML	Q99445	158 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	EFCC1	Q9HA90	598 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		19.87	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GCLM	P48507	274 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NR2E1	Q9Y466	385 aa		19.86	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PHF2	O75151	1096 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R2A	P63151	447 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	HOOK3	Q86VS8	718 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ALG3	Q92685	438 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	VEZT	Q9HBM0	779 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559		E7EVH7	732 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PODXL	O00592	558 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR1	Q13613	665 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	KRT71	Q3SY84	523 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PARP2	Q9UGN5	583 aa		19.85	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF536	O15090	1300 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	MFAP3	P55082	362 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PACS2	Q86VP3	889 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	JAML	Q86YT9	394 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf19	Q8IY42	314 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	NCKAP1L	P55160	1127 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		19.84	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CROCCP2	Q86T23	111 aa		19.84	■□□□□ 0.77

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