RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC51	Q96ER9	411 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPH	P41219	470 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT17	Q04695	432 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PADI6	Q6TGC4	694 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TLE6	Q9H808	572 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PER2	O15055	1255 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT3	O60512	393 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP11B2	P19099	503 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MCTP1	Q6DN14	999 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NOTUM	Q6P988	496 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CPB2	Q96IY4	423 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF25	Q9BQ70	676 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IPP	Q9Y573	584 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIO	O75962	3097 aa		24.14	■■□□□ 1.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNC3	Q14003	757 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP6	Q16828	381 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CNNM3	Q8NE01	707 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	BSND	Q8WZ55	320 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CSRNP2	Q9H175	543 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	RSAD1	Q9HA92	442 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	HIDE1	A8MVS5	230 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	INPPL1	O15357	1258 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT5	O43286	388 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MBTPS2	O43462	519 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	EYA4	O95677	639 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	GALT	P07902	379 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFV1	P49821	464 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	COASY	Q13057	564 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CLUL1	Q15846	466 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB34	Q9BZG1	259 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF39	Q9H2S5	420 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CD207	Q9UJ71	328 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM50B	Q9Y247	325 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	STK24	Q9Y6E0	443 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GUA9	196 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CARNS1	A5YM72	827 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PP2D1	A8MPX8	630 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BQV1	296 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF21	Q96ID5	467 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD8	Q9H461	694 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DDHD2	O94830	711 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL4A	Q13619	759 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM187B	Q17R55	369 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	GJD3	Q8N144	294 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	BACH2	Q9BYV9	841 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	HES2	Q9Y543	173 aa		24.11	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	FSD2	A1L4K1	749 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA4	P13612	1032 aa		24.1	■■□□□ 1.45
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC25A	P30304	524 aa		24.1	■■□□□ 1.45

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