RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	COG3	Q96JB2	828 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ANO3	Q9BYT9	981 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RFXAP	O00287	272 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KDM1A	O60341	852 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PRL	P01236	227 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	C8A	P07357	584 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IL13	P35225	146 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SCAND1	P57086	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	IL13RA1	P78552	427 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	ITK	Q08881	620 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	E2F7	Q96AV8	911 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	POLK	Q9UBT6	870 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FFAR3	O14843	346 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NUAK1	O60285	661 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	GC	P02774	474 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY8	P40145	1251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TXK	P42681	527 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CD83	Q01151	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ROM1	Q03395	351 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MTMR1	Q13613	665 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CT83	Q5H943	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FERMT3	Q86UX7	667 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FOXB1	Q99853	325 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SBNO1	A3KN83	1393 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NSD2	O96028	1365 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	COL6A1	P12109	1028 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY2	Q08462	1091 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	WRNIP1	Q96S55	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP12	Q02952	1782 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS38	A1L453	326 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934		H0Y858	1186 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CYP7B1	O75881	506 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KNG1	P01042	644 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF28	P17035	718 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	HSPA1L	P34931	641 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ERVK-21	P61565	698 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	STIL	Q15468	1287 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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