RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SEMA4DQ92854 862 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 GNGT1P63211 74 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ISCUQ9H1K1 167 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 INTUQ9ULD6 942 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PLAAQ9Y263 795 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CES2O00748 559 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ANXA13P27216 316 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PPFIA1Q13136 1202 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 KIF22Q14807 665 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 BSNDQ8WZ55 320 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CENPHQ9H3R5 247 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NCANO14594 1321 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 GRIN2DO15399 1336 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 EPC2Q52LR7 807 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ANO5Q75V66 913 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NEK9Q8TD19 979 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 KRT35Q92764 455 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 BTBD6Q96KE9 485 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TULP2O00295 520 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 LLGL1Q15334 1064 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SRLQ86TD4 932 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM206Q9H813 350 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CYP26A1O43174 497 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PXMP2Q9NR77 195 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 IVLP07476 585 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 HSD17B3P37058 310 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 GTF2BQ00403 316 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 GLG1Q92896 1179 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MYO1CO00159 1063 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MXI1P50539 228 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 WHAMMQ8TF30 809 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ALG6Q9Y672 507 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD62A6NC57 917 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CHRNB2P17787 502 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NPTX2P47972 431 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 GUCY1A3Q02108 690 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF862O60290 1169 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CCT5P48643 541 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MREGQ8N565 214 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 LPAR1Q92633 364 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PPFIA4O75335 1185 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 MMEP08473 750 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 DENND3A2RUS2 1198 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 VWA5AO00534 786 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 ZEB2O60315 1214 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PEX10O60683 326 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PSMC5P62195 406 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 C4orf19Q8IY42 314 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM260-216ENST00000557657 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms