RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	NCAPH	Q15003	741 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CA12	O43570	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	B4GALT3	O60512	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	NF2	P35240	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNJ6	P48051	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CASP7	P55210	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	NOG	Q13253	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	SHD	Q96IW2	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PLIN1	O60240	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF28	P17035	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ADAM9	Q13443	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	SV2C	Q496J9	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	VPS11	Q9H270	941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339		X6R8D5	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	XDH	P47989	1333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	LAMB2	P55268	1798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	DGKI	O75912	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ICAM4	Q14773	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	G2E3	Q7L622	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	GREM2	Q9H772	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-240	ENST00000556339	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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