RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554058.1

VASH1-AS1-201, VASH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VASH1-AS1, Length 871 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASH1-AS1-201ENST00000554058 USP28Q96RU2 1077 aa16.72■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.72■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 STK24Q9Y6E0 443 aa16.72■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SFI1A8K8P3 1242 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FGF18O76093 207 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 APOL6Q9BWW8 343 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CSRNP2Q9H175 543 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FZD8Q9H461 694 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MIOSQ9NXC5 875 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 IPPQ9Y573 584 aa16.71■□□□□ 0.27
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NPTXRO95502 500 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LAG3P18627 525 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NAMPTP43490 491 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RAB27AP51159 221 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SLC12A3P55017 1021 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ERVFC1P60507 584 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PKP1Q13835 747 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NOTUMQ6P988 496 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 EPSTI1Q96J88 318 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ASB2Q96Q27 587 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GBP3Q9H0R5 595 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 RSAD1Q9HA92 442 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.7■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DLL1O00548 723 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LINC01565O15544 149 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DDHD2O94830 711 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 POMCP01189 267 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PRKCBP05771 671 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PLA2G4BP0C869 781 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SKIP12755 728 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 AKAP5P24588 427 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 AXLP30530 894 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PEX3P56589 373 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BCAR1P56945 870 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 HYAL1Q12794 435 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ARSHQ5FYA8 562 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 DEPTORQ8TB45 409 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 HLA-CQ95604 372 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PGBD4Q96DM1 585 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZNF558Q96NG5 402 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 IGFLR1Q9H665 355 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 A0A1B0GUA9 196 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 BMP15O95972 392 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ITGA4P13612 1032 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 PLCG1P19174 1290 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 UBA7P41226 1012 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NPTX2P47972 431 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 MCM6Q14566 821 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 FAM187BQ17R55 369 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 KIFAP3Q92845 792 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 AK8Q96MA6 479 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 ZFP42Q96MM3 310 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 AAASQ9NRG9 546 aa16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
VASH1-AS1-201ENST00000554058 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms