RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 PAK1Q13153 545 aa22.43■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 USP38Q8NB14 1042 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 NELFBQ8WX92 580 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 BICD1Q96G01 975 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 TSG101Q99816 390 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 BICDL2A1A5D9 508 aa22.42■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 P2RX5Q93086 422 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.42■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.42■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 PDXKO00764 312 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 ZPBP2Q6X784 338 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.41■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 TBX21Q9UL17 535 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 LRRC63Q05C16 580 aa22.4■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-215ENST00000532308 ALPK3Q96L96 1907 aa22.39■■□□□ 1.18
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TSTA3-215ENST00000532308 LPIN1Q14693 890 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.38■■□□□ 1.17
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TSTA3-215ENST00000532308 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.38■■□□□ 1.17
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TSTA3-215ENST00000532308 SMTNL1A8MU46 457 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 N4BP3O15049 544 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 B4GALT5O43286 388 aa22.37■■□□□ 1.17
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TSTA3-215ENST00000532308 NFIL3Q16649 462 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 TOM1L1O75674 476 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 TIMP1P01033 207 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 RAG1P15918 1043 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 GARTP22102 1010 aa22.36■■□□□ 1.17
TSTA3-215ENST00000532308 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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