RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPK6Q16659 721 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 UBXN11Q5T124 520 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CPB2Q96IY4 423 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH23Q9H251 3354 aa20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A087X0B3 334 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 SFI1A8K8P3 1242 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 B4GALT5O43286 388 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKCBP05771 671 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 EFNA5P52803 228 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 SHC4Q6S5L8 630 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF169Q8NCN4 708 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 REEP2Q9BRK0 252 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CITO14578 2027 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.98■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC169A6NNP5 214 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 ACKR2O00590 384 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PLS3P13797 630 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 FOSL2P15408 326 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 STAT6P42226 847 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 EPC2Q52LR7 807 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM192Q8IY95 271 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 ABI1Q8IZP0 508 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1B0GUA9 196 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 RFXAPO00287 272 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 EDN1P05305 212 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 GIT2Q14161 759 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRE1Q14246 886 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PDILTQ8N807 584 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CNNM3Q8NE01 707 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 LPPQ93052 612 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PGBD4Q96DM1 585 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA32Q96LK8 384 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 CASD1Q96PB1 797 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 PANK2Q9BZ23 570 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 K7ERI5 159 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM13AO94988 1023 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 LIG1P18858 919 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 CTNNB1P35222 781 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF131P52739 623 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SV2BQ7L1I2 683 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 HELQQ8TDG4 1101 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 N4BP3O15049 544 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC16A4O15374 487 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 LPXNO60711 386 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 BMPR1AP36894 532 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SMTNP53814 917 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 E2F4Q16254 413 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 LONRF3Q496Y0 759 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 RESP18Q5W5W9 173 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC43Q8N309 656 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 PARVGQ9HBI0 331 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 IPPQ9Y573 584 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-208ENST00000531226 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
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