RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 CPB2Q96IY4 423 aa26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJB4Q9UDY4 337 aa26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.61■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ST18O60284 1047 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 RPA1P27694 616 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 POU5F1BQ06416 359 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNC3Q14003 757 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 TFDP1Q14186 410 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 SMRP1Q8NCR6 262 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF39Q9H2S5 420 aa26.6■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 B4GALT5O43286 388 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ERLIN2O94905 339 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 GALTP07902 379 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT17Q04695 432 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 COASYQ13057 564 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ADHFE1Q8IWW8 467 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 PGBD4Q96DM1 585 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 NACC1Q96RE7 527 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM50BQ9Y247 325 aa26.59■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 DDHD2O94830 711 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC11A1P49279 550 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 TMC7Q7Z402 723 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 BSNDQ8WZ55 320 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 GBP3Q9H0R5 595 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 RSAD1Q9HA92 442 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 C11orf16Q9NQ32 467 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 HES2Q9Y543 173 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 IPPQ9Y573 584 aa26.58■■□□□ 1.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 PTGDRQ13258 359 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 IL17AQ16552 155 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ERMNQ8TAM6 284 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 IGSF21Q96ID5 467 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CSRNP2Q9H175 543 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.57■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 PI4K2BG5E9Z4 385 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 AXLP30530 894 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 NOTUMQ6P988 496 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 PADI6Q6TGC4 694 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 AUTS2Q8WXX7 1259 aa26.56■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 PP2D1A8MPX8 630 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 POMCP01189 267 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP11B2P19099 503 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC51Q96ER9 411 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM169Q96HH4 297 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBP1Q9H171 429 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 POLD4Q9HCU8 107 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.55■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 GJB2P29033 226 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS52Q8N1B4 723 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 URGCPQ8TCY9 931 aa26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGA4P13612 1032 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 HAUS3Q68CZ6 603 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 MCTP1Q6DN14 999 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 SYCE2Q6PIF2 218 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFP42Q96MM3 310 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 GAD1Q99259 594 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 MIOSQ9NXC5 875 aa26.53■■□□□ 1.84
PACSIN3-204ENST00000528201 ARL5CA6NH57 179 aa26.52■■□□□ 1.84
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