RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSNARE1-208ENST00000524325 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 RBSNQ9H1K0 784 aa24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-208ENST00000524325 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.589e-8■■■■■ 27.9
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