RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 URGCPQ8TCY9 931 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 EML1O00423 815 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 DEXIO95424 95 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 GALNT17Q6IS24 598 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 RSAD1Q9HA92 442 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 PPME1Q9Y570 386 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 ALDH2P05091 517 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 KLRC2P26717 231 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 NPEPPSP55786 919 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 PPP2R5CQ13362 524 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 TDGQ13569 410 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 UBXN11Q5T124 520 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 VAV3Q9UKW4 847 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 NRP1O14786 923 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 SLC37A4O43826 429 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.041e-323■■■■□ 26.7
RPS20-210ENST00000523936 NPR3P17342 541 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 LETM2Q2VYF4 491 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 RUFY3Q7L099 469 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 KCNK12Q9HB15 430 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.52■■□□□ 1.04
RPS20-210ENST00000523936 SOD2P04179 222 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 AOC1P19801 751 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 INF2Q27J81 1249 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 FLCNQ8NFG4 579 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 CEP170P1Q96L14 293 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 FAM20AQ96MK3 541 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 INPPL1O15357 1258 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 EFEMP2O95967 443 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 POMCP01189 267 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 RFC5P40937 340 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 C4orf19Q8IY42 314 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 CNNM3Q8NE01 707 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 TMEM143Q96AN5 459 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 MARCH5Q9NX47 278 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 CPLX1O14810 134 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 ASAP2O43150 1006 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 PI15O43692 258 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 URODP06132 367 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 FOXK2Q01167 660 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 AIFM3Q96NN9 605 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS20-210ENST00000523936 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms