RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTG2Q9H4K7 406 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-397P-201ENST00000516226 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 M0R2C6 588 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT37O76014 449 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1RP00736 705 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GAAP10253 952 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 HK1P19367 917 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR15P49685 360 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL17RAQ96F46 866 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPC1Q9H2F5 836 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 AHRRA9YTQ3 701 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA0355O15063 1070 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH1A2O94788 518 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GZMKP49863 264 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRG3P56975 720 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR16Q569H4 304 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 C2orf27AQ580R0 203 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 FGD2Q7Z6J4 655 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYBUQ9NX95 663 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 B5MCH6 92 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 DVL2O14641 736 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 TYRP1P17643 537 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITGB6P18564 788 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD40P25942 277 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GUCY1B3Q02153 619 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PASD1Q8IV76 773 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR5M3Q8NGP4 307 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 RSAD2Q8WXG1 361 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAVIN3Q969G5 261 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 TANGO6Q9C0B7 1094 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT8AQ9H1J5 351 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNTG2Q9NY99 539 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 DKK2Q9UBU2 259 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIPSLA2A3N6 862 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBX4O00257 560 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 STC2O76061 302 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBP3P10745 1247 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEC24CP53992 1094 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 DUSP2Q05923 314 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRC32Q14392 662 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 NAALADL2Q58DX5 795 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF18BQ86Y91 864 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF428Q96B54 188 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 OPA1O60313 960 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ESRRBO95718 433 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.1 ms